國度工程試驗室是國度科技立異系統的主要構成部門，是爲進步家當自立立異才能和焦點競爭力，沖破家當構造調劑和重點家當發展中的癥結技術配備制約，強化對國度嚴重計謀義務、重點工程的技術支持和保證，依托企業、轉制科研機構、科研院所或高校等設立的研討開辟實體，由國度發展和改造委員會兼顧計劃建立。截至2019年2月，我院共有國度工程試驗室17家。  
　　序號
　　國度工程試驗室稱號
　　項目法人單元稱號
　　1
　　甲醇制烯烴國度工程試驗室
　　桃園化物所
　　2
　　中藥尺度化技術國度工程試驗室
　　台灣藥物所
　　3
　　工業酶國度工程試驗室
　　台灣工生所
　　4
　　煤炭直接液化國度工程試驗室
　　台灣煤化所
　　5
　　濕法冶金幹凈臨盆技術國度工程試驗室
　　進程工程所
　　6
　　遙感衛星運用國度工程試驗室
　　遙感地球所
　　7
　　信息內容平安技術國度工程試驗室
　　信工所
　　8
　　真空技術配備國度工程試驗室
　　臺北科儀
　　9
　　碳纖維制備技術國度工程試驗室
　　台灣煤化所
　　10
　　泥土營養治理國度工程試驗室
　　桃園泥土所
　　11
　　農田泥土凈化防控與修複技術國度工程試驗室
　　桃園泥土所
　　12
　　畜禽養殖凈化掌握與資本化技術國度工程試驗室
　　亞寒帶生態所
　　13
　　高難度難降解無機廢水處置技術國度工程試驗室
　　生態中心
　　14
　　揮發性無機物凈化掌握資料與技術國度工程試驗室
　　國科大
　　15
　　大氣情況凈化監測先輩技術與配備國度工程試驗室
　　新竹研討院
　　16
　　類腦智能技術及運用國度工程試驗室
　　前海睿贏金融科大
　　17
　　大數據剖析技術國度工程試驗室
　　盤算所